Please Login

Τροποποιήθηκε Τρίτη, 17 Ιανουαρίου 2017

Τίτλος μαθήματος

Πηγές Βιοπληροφόρησης

Κωδικός μαθήματος

ΥΠ004

Υπεύθυνος μαθήματος

Δοξάνη Χρυσούλα

Διδάσκοντες

Στεφανίδης Ιωάννης, Δοξάνη Χρυσούλα, Κόκκαλη Χρυσούλα, Μηλίγκος Μιχάλης, Πανίδης Δημήτρης, Μπρότσης Θεόδωρος, Νταλαμάγκα Μαριάννα, Οικονόμου Σταυρούλα, Κωνσταντίνος Πατεράκης

Τρόπος διεξαγωγής

Παράδοση μαθημάτων μέσω διαλέξεων και εργαστηριακών ασκήσεων

Ταυτότητα μαθήματος

Υποχρεωτικό μάθημα – A΄ εξαμήνου

Λέξεις κλειδιά για αναζήτηση στο διαδίκτυο

PubMed, SCOPUS, Cochrane Library, ClinicalTrials.gov, EU Clinical Trials Register , SNP, GENE, OMIM, HapMap, GeneCards, SNPs3D, PDB, NCBI dbGaP, PDGene, AlzGene database, Genome.gov, HuGE Navigator

Σκοποί και Στόχοι του μαθήματος

Στόχοι του μαθήματος είναι η απόκτηση γνώσεων ώστε οι φοιτητές να έχουν την ικανότητα:

  • να ανατρέχουν με ευχέρεια στις βάσεις βιολογικών και γενετικών δεδομένων στο διαδίκτυο
  • να ανατρέχουν με ευχέρεια στις βάσεις βιβλιογραφικών δεδομένων βιολογικής και ιατρικής έρευνας
  • να ανατρέχουν με ευχέρεια στις βάσεις δεδομένων κλινικών μελετών
  • να επιλέγουν την κατάλληλη βάση ανάλογα με το ερευνητικό ερώτημα
  • να εξαντλούν όλες τις πληροφορίες που μπορούν να εξάγουν από μια διαδικτυακή βάση δεδομένων

Μέθοδος διδασκαλίας

Η διδασκαλία του μαθήματος γίνεται υπό τη μορφή ακαδημαϊκών διαλέξεων και πρακτικών ασκήσεων σε Η/Υ

Τρόπος και κριτήρια αξιολόγησης

Εργασίες (100%)

Βιβλιογραφία

  • The Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions. The Cochrane Collaboration. Version 5.1.0, 2011
  • H. Fletcher, I. Hickey, P. Winter. BIOS Instant Notes in Genetics, Taylor & Francis; 2nd edition edition, 2002

Ημερολογιακός προγραμματισμός και περίγραμμα διδακτικής ύλης

Διαλέξεις
(Α/Α)
Ημερ/νία
Ώρα
Εισηγητές Τίτλος και Περιεχόμενα Διαλέξεων
1. 17/12/16
9:00-11:00
Δοξάνη Χρυσούλα
Νταλαμάγκα Μαριάννα
Μηλίγκος Μιχάλης
Μπρότσης Θεόδωρος
Κων/νος Πατεράκης
Terminology of Clinical Trials

RCT, systematic review, meta-analysis
adverse events, observational study etc.

2. 17/12/16
11:00-14:00
Δοξάνη Χρυσούλα
Νταλαμάγκα Μαριάννα
Οικονόμου Σταυρούλα
Πανίδης Δημήτρης
Κων/νος Πατεράκης
Literature databases

PubMed
SCOPUS
Cochrane Library (Cochrane Database of Systematic Reviews,
Cochrane Central Register of Controlled Trials, Health
Technology Assessment Database)

3. 17/12/16
15:00-18:00
Πανίδης Δημήτρης Clinical trials databases

ClinicalTrials.gov
EU Clinical Trials Register
International Clinical Trials Registry Platform
ENCePP E-Register of Studies

4. 18/12/16
9:00-12:00
Δοξάνη Χρυσούλα
Νταλαμάγκα Μαριάννα
Στεφανίδης Ιωάννης
Κόκκαλη Χρυσούλα
Κων/νος Πατεράκης
Introduction to basic biology and genetics

DNA, base pairs, RNA, genetic code, gene, trait, phenotype, 
allele, polymorphism, genetic locus, EST, SNP, tag SNP, degree
 of recombination (θ), cM, genetic markers,
STRs  (microsatellites), meiosis, chromosome, ecombination, 
intron, exon, gene expression, DNA microaaray, 
dominance/recessiveness, protein synthesis,
protein structure, levels of protein structure

5. 18/12/16
13:00-15:00
Δοξάνη Χρυσούλα
Νταλαμάγκα Μαριάννα
Οικονόμου Σταυρούλα
Στεφανίδης Ιωάννης
Κόκκαλη Χρυσούλα
Κων/νος Πατεράκης
Genetic Epidemiology databases

Genome.gov
HuGE Navigator (HuGE Literature Finder, Phenopedia, Genopedia,
GWAS Integrator)

6. 18/12/16
15:00-18:00
Δοξάνη Χρυσούλα
Νταλαμάγκα Μαριάννα
Οικονόμου Σταυρούλα
Στεφανίδης Ιωάννης
Κόκκαλη Χρυσούλα
Κων/νος Πατεράκης
Biological and genetics databases

SNP
GENE
OMIM
HapMap
GeneCards
SNPs3D
PDB

Προηγούμενο μάθημα Επόμενο μάθημα

Διεύθυνση: Παπακυριαζή 22, Λάρισα 41222
Development by the Molecular Evidence - Based Medicine Unit
Τελευταία ενημέρωση: 26/04/2017
Ενημέρωση Cumagas DB: 02/10/2010
Σχεδιασμός, Προγραμματισμός και Υλοποίηση: Theodoros Mprotsis

© Με επιφύλαξη κάθε νόμιμου διακαιώματος 2017 Εργαστήριο Βιομαθηματικών. Σχολή Επιστημών Υγείας. Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας